El actual seminario de La Seu d’Urgell fue construido en tiempos del obispo Josep Caixal (1853-1879), conocido por su carácter conservador y por su militancia en la causa carlina.
Fue edificado a las afueras de la población, en el sector norte, en sustitución del seminario anterior que se construyó en el año 1592, en tiempos del obispo Andreu Capella, donde actualmente está la iglesia de la Misión.
En el año 1860 se colocaba la primera piedra del nuevo seminario, cuyas obras no acabarían hasta principios del siglo XX. Concebido como una obra de dimensiones colosales por el arquitecto Romà Samsó, el Seminario Conciliar es un edificio con un largo pabellón de cuatro pisos y desván, con tres alas proyectadas hacia el sur, de estilo historicista con un marcado regusto neorrománico. En su momento, fue el gran referente cultural y educativo de los Pirineos.